In acest film, amiralul Kirk se alatura lui Spock si McCoy intr-o noua misiune.
Intentia lui Khan de a folosi Proiectul Genesis este impiedicata de sacrificiul lui Spock..
Khan, dornic de razbunare, in fruntea unor prizonieri semi-salbatici, reuseste sa se amestece in Prroiectul Genesis, creat pentru a readuce viata pe planetele moarte. (episodul Space Seed).
In timpul misiunii il intalnesc pe vechiul lor dusman, Khan, un lider supravietuitor al razboaielor eugenice.
In acest film, amiralul Kirk se alatura lui Spock si McCoy intr-o noua misiune